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醫學的進步日新月異，醫學的分工也隨之精密。歐美國家的前輩醫師早在100多年即開始倡議將大腸直腸外科發展成為獨立的專科，這樣的發展使得結腸、直腸、肛門疾病的研究和治療有了長足的進步。

馬偕醫院的大腸直腸外科於民國60年成立，成為獨立的專科。經過30多年來,許多前輩醫師的努力，本科也孕育了許多大腸直腸外科的專科醫師在全國各醫院，為罹患結腸、直腸、肛門疾病的民眾服務。同時也從事大腸直腸外科相關的醫學研究，參與國內外醫學會與發表論文。

本科也在民國60年7月成立「腸造口治療室」從事專業的腸造口照護。院方當時特別派遣優秀的護士同仁，到美國接受專業的訓練成為腸造口治療師(簡稱造口師)，讓接受造口手術的病患有更專業的照顧。使得接受腸造口手術的患者的生活品質得到提升，建立信心可以自我照顧，並且從事正常的工作。