職業醫學科屬於臨床醫學與預防醫學之間的整合專科, 目前有專任職業醫學專科主治醫師一名及家庭醫學專科主治醫師(具職業醫學專科醫師資格)三名,主要任務在職業傷害與職業病的診斷鑑定與治療、疑似職業病通報、職業安全衛生建議、職業病預防宣導、工作環境評估、職業病衛教諮詢等,並協助執行勞工一般及特殊作業健康檢查、特殊作業健康檢查的分級管理、追蹤複查(如北市府勞工鳳凰計畫)、復工、配工、臨場訪視以及員工職場健康促進事宜。